Кейр Томас, автор посвященной Ubuntu Linux книги, был немало удивлен, когда после публикации электронной версии произведения на собственном сайте, с ним связались представители компании Canonical и сообщили, что использование логотипа Ubuntu требует особого разрешения. Разумеется, оно было тут же дано, но сам факт указывает на то, что сторонники СПО, обращая внимание только на несовершенство патентного законодательства, недооценивают потенциальную угрозу со стороны владельцев торговых марок.
Эти опасения не выглядят надуманными. Достаточно вспомнить о том, что в состав нескольких популярных дистрибутивов Linux вместо браузера Firefox было решено включить его аналог Iceweasel, отличающийся от оригинала только тем, что из него убраны все компоненты, связанные с торговой маркой. Причиной этому послужил запрет организации Mozilla, владеющей торговой маркой Firefox, на поставку этой программы, если в ней имеются патчи, не получившие официального одобрения.