В апреле началась реализация очень важного вычислительного проекта, в котором может принять участие любой желающий. Инициаторами его выступили Оксфордский университет (Великобритания), Национальный фонд изучения рака (шт. Мэриленд, США), корпорация Intel и фирма United Devices при поддержке еще нескольких организаций.
Приложение проверяет топологическое соответствие и тем самым помогает найти ингибитор протеина для борьбы с лейкемией
Приложение, созданное в United Devices (см. иллюстрацию), может работать в фоновом режиме и даже выполнять роль скринсэйвера, но при этом программа ищет топологические соответствия между молекулами лекарственных препаратов и протеинов, что может сыграть существенную роль при лечении рака.
Пока я пишу эту заметку, установленное на моей системе приложение ведет поиск химических ингибиторов для протеина SOD (superoxide dismutase - перекись дисмутазы), которые могли бы удалять из организма опасные свободные радикалы. Совсем недавно, в сентябре прошлого года, журнал Nature сообщил, что молекула 2-метоксиэстрадиола подавляет активность SOD, убивая клетки лейкемии без ущерба для здоровых тканей.
Среди детей, умерших от рака, примерно треть являются жертвами лейкемии, поэтому я искренне надеюсь, что новая программа поможет найти хотя бы еще один аналог 2-метоксиэстрадиола.
Приложение можно бесплатно скачать по адресу: members.ud.com/download/ gold. Результаты проекта будут опубликованы и станут интеллектуальной собственностью Оксфордского университета и Фонда изучения рака, а не какой-нибудь частной фармацевтической компании.
Новому проекту посвящен специальный Web-узел www.chem.ox.ac.uk/curecancer.html.